Los Laboratorios de Química dan soporte a los cursos de ciencias básicas que se imparten en nuestra Institución Sanjuanina. Las instalaciones cuentan con la infraestructura adecuada para dar apoyo tecnológico y fortalecimiento en los aspectos cognitivos a través del desarrollo de diferentes prácticas de docencia. Así, los alumnos adquieren conocimientos, habilidades y destrezas a través de la manipulación de materiales y manejo de equipos e instrumentos. 

En los Laboratorios de Química se realizan experimentos prácticos como:

Reacciones químicas, separación de mezclas, preparación de soluciones, equilibrio química, densidad del aire, calor específico, equilibrio líquido - vapor. También se realiza el control de calidad en el agua con la determinación del pH, dureza total, cloruros, alcalinidad total, ablandamiento de agua, oxígeno disuelto. Además, se estudia el aire y sus contaminantes. Estos procedimientos servirán para comprender las características y bondades de los alimentos.